WIP: database class.

- 修正disk拼写
- 为测试项目添加dylib引用
- 修复无法打开数据库的问题
- 为Deepseek TUI更新Agents.md

llm-assist/AGENTS.md

@@ -37,3 +37,24 @@ dotnet test --filter "FullyQualifiedName~ClassName.MethodName"  # Run single tes
 - Code and comments are in **Chinese**.
 - Namespace: `OCES.Resonance.Core` (Core), `OCES.Resonance.AtlFieldExtractor` (extractor), `OCES.Resonance.Core.Tests` (tests).
 - Git commit style: `WIP: <description>` (no conventional commits).
+
+## AI 助手工具说明（DeepSeek TUI）
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+当前工作环境为 DeepSeek TUI，文件操作工具采用**延迟加载**机制，不在初始工具列表中。首次调用会触发加载并返回 schema 提示（不执行），用正确参数重试后正常执行。
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+### 可用文件操作工具
+
+| 工具 | 用途 | 参数注意事项 |
+|------|------|-------------|
+| `write_file` | 创建/覆盖文件 | `path` + `content` |
+| `edit_file` | 单次查找替换 | `path` + `search` + `replace`（注意不是 `old_string`/`new_string`） |
+| `apply_patch` | 结构化 patch（多块变更） | `path` + `patch`（unified diff 格式） |
+| `read_file` | 读取文件 | `path`，支持 `start_line`/`max_lines` 分页；PDF 自动提取 |
+| `list_dir` | 列出目录 | `path`（可选） |
+| `grep_files` | 正则搜索文件内容 | `pattern`，支持 `include`/`exclude` glob、`context_lines` |
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+### 使用模式
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+- 写入/编辑/打补丁：需**两次调用**（首次触发加载，第二次执行）
+- 读取/搜索：直接可用，单次调用
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